Il comune di Pura è formato dal nucleo, dall'abitato circostante il nucleo e dalle frazioni di Magliasina e Moriscio. La forma dialettale del nome è Püria o Püra.Pura confina a nord con Curio e Bedigliora, a nord-est con Neggio, a sud-est con Caslano, a sud con Ponte Tresa, a ovest con Croglio e ad est con Magliaso. Il confine comunale non segue regolarmente caratteristiche specifiche del territorio, fatta eccezione per il corso del fiume Magliasina (confine con Neggio). A sud-est esso segue l'antica strada che conduce dalla Magliasina in direzione di Ponte Tresa (Strada Regina) e si mantiene immediatamente a monte del tracciato della ferrovia Lugano-Ponte Tresa fino all'approssimarsi dell'abitato di questo comune.